故事发生在一条即将拆迁的老街上，社畜青年赵小满下班后误入一家只在深夜出现的“洞洞杂货店”。店里摆满了带着各种大小“洞”的奇怪物品——能吸走噩梦的捕梦网、可以听到远方亲人声音的海螺、能让人看到十年后自己模样的破旧镜子。店主是个戴着圆框眼镜、永远在打瞌睡的老爷爷。赵小满在帮助老爷爷整理这些“有洞”的物件时，见证了无数都市夜归人的孤独与期盼，她也在这段奇遇中，治愈了自己被现实磨得千疮百孔的心。
一对即将离婚的夫妻来到店里，老爷爷给了他们一面有裂纹的镜子。夫妻俩看着镜中裂痕里浮现的往昔美好回忆，相拥而泣，决定再给彼此一次机会。这是赵小满见过的最完整的“修补”。
一个离家出走的少年在海螺里听到了母亲带着哭腔的呼唤，他瞬间泪崩，问老爷爷能不能把这个海螺卖给他。老爷爷说：“它本来就是你的，我只是帮你找到它。”少年连夜赶回了家。
一位总是做噩梦的失眠患者买走了捕梦网，第二天他来道谢，说终于睡了个好觉。赵小满好奇地碰了碰捕梦网，发现它变得沉甸甸的，老爷爷说：“因为里面装满了他的噩梦。”
一个女孩在店里躲雨，看中了一把破了个洞的雨伞。老爷爷说这把伞能让你见到最想见的人。女孩打着伞冲进雨里，竟然在街角遇到了她去世多年的爷爷（幻影），爷爷笑着对她挥了挥手。
一个社畜把一枚硬币投进店里的招财猫存钱罐，许愿能涨工资。第二天他真的被通知加薪了，但他却跑来退货，说：“不是靠自己努力得到的钱，拿着不安心。”老爷爷欣慰地笑了。
赵小满加班到深夜，又下雨又冷，她狼狈地躲进一条从没见过的巷子，看到了“洞洞杂货店”温暖的灯光。推门进去，老爷爷正趴在柜台上打瞌睡，仿佛等了她很久很久。